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1월 12일 토요일 - 강남 토즈
참석자: 양경성 부장님, 김범채 랩장, 김윤영 연구원, 양재민 연구원
모임 내용 정리
현재까지 진행사항을 검토하고, 남은 기간동안 3기 활동을 마무리 짓기 위한 회의였습니다.
진행사항:
병리학 슬라이드 영상에 딥러닝을 적용해보기 위한 다양한 코드들을 찾고 실행해 보았습니다.
1. “Deep learning for digital pathology image analysis: A comprehensive tutorial with selected use cases” http://www.andrewjanowczyk.com/deep-learning/
위에 보이는 다양한 병리학 데이터 들과 이를 해결하기위한 샘플 tutorial 을 제공합니다.
그러나, 대부분 Matlab 코드로 제공이 되어있어서 라이센스가 없으면 돌려보기가 어렵다는 문제가 있습니다. 이를 좀더 편하게 사용하기 위해 Python으로 변형하는 작업을 진행하고 있습니다.
완성된 코드는 추후 공개할 예정입니다.
2. Mask R-CNN for Nuclei Segmentation https://github.com/matterport/Mask_RCNN
Python 으로 공개된 코드를 직접 학습하고, 그 결과를 확인해 보았습니다.
현재 In-house 데이터 셋으로 결과를 직접 확인하기 위한 전처리 작업을 진행 중입니다.
위 작업은 김윤영 연구원과 양재민 연구원이 고생해서 이룬 성과입니다.
랩장으로써 이번 기수에서는 참여가 저조 했기 때문에 좀더 연구원들에게 보탬이 되고자 관련 논문 자료들과 AI 방법론에 대해 간략하게 이론을 설명해주기로 했습니다.
관련 논문들을 조사하여 지금까지는 다른 사람들의 코드를 참고하여 연구를 진행했지만, 우리만의 모델을 만들 수 있도록 노력하겠습니다.
다음에는 더 좋은 소식을 업데이트 하겠습니다.
